Clínicas estéticas en México: 10 software comparados

Para una clínica estética en México, el software se elige por dos cosas que casi nunca vienen juntas: que registre el tratamiento (zona, producto, lote, foto antes y después, sesiones del paquete) y que timbre el CFDI 4.0 ante el SAT separando lo exento del 16% de IVA. Revisamos el sitio de 10 opciones el 21 y 22 de octubre de 2026: solo Kliniko, Doctocliq y TotalMed nombran el CFDI, y solo Nimbo figura en el padrón NOM-024 de la DGIS.

Actualizado el 22 de octubre de 2026: entran Sedna y Velka Medical, dos mexicanos de estética que ChatGPT recomienda y que la primera versión no tenía.

Cómo hicimos la tabla. Revisamos el sitio de cada uno el 21 de octubre de 2026 (Sedna y Velka Medical, el 22) y buscamos tres cosas: si nombra el CFDI o el SAT, si publica precio en pesos y si tiene página de México; el padrón NOM-024 lo leímos en la DGIS esos mismos días. Si algo no aparece en su sitio, no lo damos por hecho, y "no lo nombra" no quiere decir "no lo hace". El orden es por origen: primero los mexicanos, luego los que tienen oficina en México y al final los que venden desde fuera, por orden alfabético. TotalMed (chileno) es nuestro producto: lo pasamos por la misma revisión y no lo pusimos primero. Si quieres verlo con tus números, está en probar TotalMed en México.

¿Qué le pides al CFDI de una clínica estética?

Le pides que separe lo exento de lo que va al 16% en el mismo comprobante. En México el IVA de un tratamiento estético depende de quién lo cobra (un médico persona física, una S.A. de C.V. o una cosmetóloga), y en la misma visita suelen mezclarse la aplicación y la crema de recepción. Cómo se clasifica cada concepto, con su artículo de ley, está en la guía de CFDI 4.0 para clínica estética y consultorio; aquí importa lo que eso le exige al software.

El error que más vemos no es técnico: es la clínica constituida como S.A. de C.V. que timbra la toxina exenta "porque la aplica la doctora", con un sistema que deja elegir el IVA a mano en recepción. Por eso la pregunta de compra en México no es "¿factura?". Es: ¿me deja poner en el mismo CFDI una línea exenta y otra al 16%, y sabe cuál es cuál según quién atendió? Y si vendes paquetes por adelantado: ¿emite el CFDI de anticipo y después el del servicio relacionado? De los 10 revisados, solo tres nombran el CFDI en su sitio; a los otros siete hay que preguntárselo en la demo.

Lo que recomienda la IA y lo que encontramos

Le preguntamos a Google Modo IA, sin sesión, por el mejor software para clínica estética en México el 21 de octubre: nombró a AgendaPro, Doctocliq, Flowww y Clinera. ChatGPT, en chat temporal el 15 de octubre, nombró a AgendaPro, Doctocliq, Nimbo y Medesk; el 22 de octubre, a Sedna (primero), AgendaPro, Kliniko, Velka Medical y Nimbo. Todos están en la tabla. Sedna y Velka entraron por esa segunda consulta: son mexicanos, hechos para estética, y en la primera versión de esta comparativa no estaban. Kliniko sigue siendo el único mexicano que publica estética, CFDI y precio en pesos a la vez. Koibox, que aparece en otras consultas de estética, devolvió error en su página de México y por eso no entra.

Los 10, de cerca

Kliniko: el mexicano con paquetes y anticipos

Kliniko es de Puebla (Rubiko) y es el que mejor calza con una clínica estética chica o mediana que quiere todo en pesos. Su página de estética describe paquetes de varias sesiones con anticipos y saldos pendientes, inventario de bótox y ácido hialurónico con trazabilidad de lotes, y agenda que evita traslapes de cabina y equipo. Cobra el timbre del CFDI aparte ($3 + IVA cada uno). No publica comparador de fotos antes y después ni mapa facial: habla de "historia clínica digital con fotos".

Nimbo: el único con NOM-024 de la lista

Nimbo (eCaresoft México) figura en el padrón de la DGIS como certificado en la NOM-024, vigente hasta el 15 de abril de 2027. Tiene página para clínicas estéticas dentro de una lista larga de segmentos, pero su sitio está pensado para clínicas ambulatorias, redes de consultorios y hospitales. No publica precio y dice que la facturación fiscal "depende del país", sin nombrar el CFDI.

Sedna: la agenda que confirma sola, en pesos

Sedna se presenta como hecho en México para clínicas estéticas y spas, y su argumento es la cita que no llega: manda el recordatorio por WhatsApp un día antes y dos horas antes, y la paciente confirma, reagenda o cancela desde el chat. Publica dos planes con 30 días de prueba sin tarjeta: Estándar a $499 MXN + IVA (agenda, reservas en línea, fotos antes y después, finanzas) y Pro a $1,199 MXN + IVA (expediente con CIE-10 y consentimientos, e inventario por lote y caducidad ligado a la paciente, que es lo que pide COFEPRIS). No nombra el CFDI ni publica paquetes de sesiones o mapa facial.

Velka Medical: el expediente con respaldo médico-legal

Velka Medical (México y Alemania, con teléfono de Guadalajara) es el que más se parece a un expediente de médico estético: mapa facial con dosis por punto, lote, caducidad y dilución, fotos antes y después en las notas de evolución, y contratos y consentimientos con firma digital. Lo que nadie más de la lista ofrece: médicos legistas que revisan tus expedientes cada dos meses. Un solo plan, Velka Pro, a $3,400 MXN al mes ($2,900 en pago anual). Su sitio dice "cumplimiento NOM-004 y NOM-024", pero no figura en el padrón de la DGIS, y no nombra el CFDI ni paquetes de sesiones.

AgendaPro: el más nombrado, sin CFDI en el sitio

Es el que más recomiendan los buscadores con IA para México. Su página de medicina estética publica expediente fotográfico con antes y después, consentimientos y venta de packs con control automático de sesiones, y sus planes están en pesos: $299, $550 y $1,500 MXN + IVA al mes. Ni esa página ni la de planes nombran el CFDI o el SAT.

Clinera: agenda llena por WhatsApp, no expediente

Clinera (Chile, con oficina en CDMX) vende otra cosa: agentes de IA que contestan WhatsApp, Instagram y Facebook y agendan, más un servicio de marketing. Desde US$279 al mes, facturado en dólares, sin costo de implementación según su página de planes del 21 de octubre. Encaja en una clínica cuyo problema es llenar la agenda, no registrar el tratamiento.

Flowww: el español para cadenas

Flowww tiene oficina en CDMX y precios en pesos ($1,400 o $2,384 MXN al mes). Su sitio de México destaca firma de consentimientos, stock, marketing automatizado y "facturación a prueba de errores", sin nombrar el CFDI. Google lo recomienda para clínicas medianas o grandes con varias cabinas.

Doctocliq: el regional que sí nombra el CFDI

Doctocliq es peruano y publica lo más completo de estética de la lista: fotos antes/después, mapeo de zonas tratadas con dosis, trazabilidad de lotes de bótox y ácido hialurónico, consentimientos firmados y facturación electrónica para México (CFDI). Plan gratis o desde US$19 al mes, precio en dólares.

Medesk: gratis para empezar, sin México en el sitio

Medesk tiene un plan gratis (2 usuarios, 1,000 pacientes, 50 citas al mes) y un Pro de $16 al mes. Su facturación electrónica va por Facele y su página de precios está armada para Colombia (RIPS). No nombra el CFDI ni tiene página de México.

TotalMed: el tratamiento y el CFDI en el mismo cobro

TotalMed es el software para clínicas estéticas de Latinoamérica: face chart sobre la foto real del paciente para marcar puntos de toxina, ácido hialurónico, bioestimulador e hilos PDO, fotos antes y después lado a lado, paquetes de sesiones con saldo por paciente e inventario con lotes y vencimientos. En México timbra el CFDI 4.0 ante el SAT desde el plan Clínica (US$75 al mes, ≈MX$1,388). También tiene módulos de odontología y otras especialidades.

Lo que no tiene, dicho claro: el paquete se vende con un solo pago por el total (o se registra sin pago y los abonos van aparte), no con anticipos dentro del paquete como Kliniko; la agenda es por profesional, no por cabina; cobra en dólares; y no figura en el padrón NOM-024. Cómo se descuenta cada sesión y qué pasa con el saldo está en paquetes de sesiones: saldo y abandono.

Del lote de toxina al paquete: lo que publica cada uno

Lo que un software dice de estética en su sitio es lo que puedes exigir en la demo. Esta tabla junta lo que cada uno publica, revisado el 21 de octubre de 2026:

Una prueba que sirve en cualquier demo: pide que registren una aplicación de toxina en tres zonas, con el lote del frasco, en la sesión 2 de un paquete de 4, y que te muestren dónde queda cada dato después. Si para eso hay que escribir en un campo de notas libres, el sistema no lo registra: lo guarda.

Si vienes de un Excel o de otro sistema, revisa antes qué se puede importar y qué no en migrar pacientes desde Excel.

¿Qué software tiene certificado NOM-024?

De los 10 revisados, solo Nimbo figura en el padrón NOM-024 de la DGIS, la lista oficial de sistemas de expediente clínico certificados (última modificación del padrón: 15 de octubre de 2026). Kliniko, Sedna, Velka Medical, AgendaPro, Clinera, Flowww, Doctocliq, Medesk y TotalMed no figuran (revisado el 22 de octubre). "Cumple con la NOM-004" o "diseñado conforme a la NOM-024" en el sitio de un proveedor no es una certificación: se comprueba en el padrón, con su fecha de vencimiento. Si tu clínica necesita el certificado (por un convenio, una aseguradora o un hospital con el que intercambias información), la lista se acorta a uno. Para una clínica estética privada que no intercambia expedientes, pesa menos que el CFDI.

Si atiendes también consulta general y quieres ver el panorama mexicano completo (Medware, Huli, SaludTotal y otros certificados), está en la comparativa de software para clínicas y consultorios en México.

¿Cuál conviene según tu clínica?

• Clínica estética chica que vende paquetes en abonos y quiere pagar en pesos: Kliniko.
• Clínica que necesita certificado NOM-024 o atiende como clínica ambulatoria: Nimbo.
• Clínica chica cuyo problema son las citas que no llegan, con lote y caducidad en pesos: Sedna.
• Médico estético que quiere el mapa facial y una revisión médico-legal de sus expedientes: Velka Medical.
• Centro de belleza o spa con mucha reserva online y poca ficha médica: AgendaPro.
• Clínica cuyo problema es llenar la agenda desde WhatsApp e Instagram: Clinera.
• Cadena con varias sucursales y equipo de marketing: Flowww.
• Consultorio que quiere empezar gratis: Doctocliq o Medesk.
• Clínica de medicina estética con inyectables que quiere el face chart, el lote, el paquete y el CFDI con lo exento y lo gravado en el mismo cobro: TotalMed.

Si vas a comparar con el resto de la región, la comparativa de 12 software para clínicas estéticas en Latinoamérica tiene la misma prueba país por país.

4 preguntas para la demo

1. ¿Quién emite el CFDI y con qué datos? Tu RFC, tu CSD y el régimen correcto (persona física, RESICO o S.A. de C.V.). Pide ver un comprobante con una línea exenta y otra al 16%.
2. ¿Cómo se paga un paquete? De una vez, en anticipos o "sin pago" con abonos aparte. Cada respuesta cambia cómo facturas el anticipo.
3. ¿Dónde queda el lote del frasco? En un campo propio del tratamiento, no en una nota.
4. ¿Qué pasa con tus fotos si te vas? Que te las puedas llevar exportadas, con la fecha de cada sesión.

¿Tu clínica cobra como persona física o como sociedad? Esa respuesta decide la mitad de esta tabla antes de ver una sola demo.

Ruben David Cedeño Abreu

Director Comercial de TotalMed. Acompaña a clínicas estéticas de México y Latinoamérica a digitalizar su operación y crecer sin perder el control de sus números.