Uruguay: elegí el software de tu consultorio (2026)

El software de consultorio en Uruguay es el sistema que junta agenda, historia clínica y cobro, y que además emite tus CFE (e-Ticket y e-Factura) ante la DGI, obligatorios para todo contribuyente de IVA desde el 1 de enero de 2025. Si sos médico, odontólogo o psicólogo independiente, la consulta se factura a la tasa mínima de IVA (10%), no a la básica de 22%, siempre que el servicio esté vinculado a la salud y estés inscripto en el registro del MSP. Elegir bien es elegir un sistema que sepa esa diferencia sin que la tengas que corregir a mano.

Actualizado el 4 de octubre de 2026.

Si querés ver cómo queda tu agenda con los CFE ya conectados, podés probar TotalMed en Uruguay con tus propios pacientes antes de decidir nada.

¿Qué tiene que resolver un software de consultorio en Uruguay?

Tiene que resolver cuatro cosas que en Uruguay no son opcionales: emitir CFE, aplicar la tasa de IVA correcta, llevar una historia clínica electrónica válida y cuidar datos que la ley trata como sensibles. Lo demás (agenda online, recordatorios, portal del paciente) es comodidad.

• CFE ante la DGI. Según la propia DGI, el plazo para que los contribuyentes de IVA que faltaban se volvieran emisores electrónicos venció el 31 de diciembre de 2024 (Resolución 2548/2023). Desde el 1 de enero de 2025, quien se inscribe o reinicia actividad nace emisor electrónico. Eso incluye a los de IVA Mínimo (literal E) y a los prestadores de servicios personales fuera de la relación de dependencia, que es exactamente la situación de un médico con consultorio propio. Quedan afuera, entre otros, los monotributistas.
• e-Ticket o e-Factura. Al paciente particular, consumidor final, le emitís e-Ticket. A una empresa o institución con RUT (una mutualista, un seguro, la empresa que paga el chequeo de sus empleados) le emitís e-Factura, con el RUT del receptor obligatorio: si el RUT está mal o inactivo, la DGI rechaza el comprobante.
• Historia clínica electrónica. El Decreto 242/017 define la historia clínica electrónica como el equivalente funcional de la de papel y regula cómo las instituciones de salud tratan e intercambian esa información. La Ley 18.335 de derechos y obligaciones de pacientes es la que fija que la historia clínica es del paciente y que tiene derecho a acceder a ella.
• Datos de salud. La Ley 18.331 de protección de datos personales trata la información de salud como dato sensible, bajo control de la Unidad Reguladora y de Control de Datos Personales (URCDP). Un Excel con diagnósticos compartido por WhatsApp es justo lo que esa ley no quiere ver.

¿Tasa mínima o tasa básica? La trampa del ticket mixto

La consulta médica va a tasa mínima: la DGI, en su guía de servicios personales, dice que tributan al 10% las prestaciones vinculadas a la salud de los seres humanos hechas por profesionales con título habilitante inscriptos en el MSP. Y lo confirmó en la Consulta Tributaria N° 6632 (2024) para una clínica odontológica, con base en el literal d) del artículo 18 del Título 10 y el Decreto 220/998.

El matiz está en "vinculadas a la salud". La misma guía de la DGI pone el ejemplo del psicólogo: la terapia va a tasa mínima, pero un test vocacional o una selección de personal van a tasa básica. Lo que no tiene vínculo con la salud cae en la regla general de 22%.

En la práctica, el error que más se repite no es de software: es la recepción que arma un solo ticket con la consulta y el protector solar que el paciente se llevó del mostrador, todo al 10%. O la consulta de una clínica estética mezclada con un tratamiento cuyo fin no es de salud. Un sistema serio separa la tasa por servicio en el catálogo, de modo que cada línea del CFE salga con su IVA y la recepción no tenga que decidirlo al cobrar. Si tenés dudas sobre un servicio puntual, la palabra final la tiene tu contador, no el software.

¿Cuánto cuesta un software de consultorio en Uruguay?

Entre cero y unos USD 100 al mes para un consultorio chico, según cuánto querés que haga el sistema y cuánto estás dispuesto a hacer vos a mano. La oferta nacida en Uruguay es corta y joven, así que la comparación honesta no es solo entre marcas: es entre armarte el combo gratis o pagar por algo que lo junte.

TotalMed: el negocio y la parte clínica en un solo sistema

TotalMed es software clínico multiespecialidad, con ficha por especialidad y facturación del organismo fiscal local incluida: en Uruguay emite e-Ticket y e-Factura ante la DGI desde el mismo cobro de la consulta. Los planes se cobran en dólares, desde USD 34 al mes, así tu precio no se mueve con el tipo de cambio. Donde más se nota la diferencia es en la gestión: caja diaria, cuentas por cobrar, paquetes de sesiones con saldo por paciente, inventario con lotes y vencimientos, comisiones a profesionales y estado de resultados. En estética, odontología y kinesiología el módulo visual ya está construido (face chart, mapa corporal, odontograma FDI, comparador antes/después). Lo que no hace hoy: no está conectado a la Historia Clínica Electrónica Nacional (HCEN).

CliniGest: barato y uruguayo, con lo justo

CliniGest es un software de gestión para clínicas y consultorios con equipo en Empalme Olmos, Canelones. Su Plan Fundador cuesta USD 25 al mes e incluye agenda, historia clínica, gestión financiera básica y recordatorios por email; tiene 7 días de prueba. Su sitio no menciona CFE ni integración con la DGI, así que, si lo elegís, preguntá cómo vas a emitir el e-Ticket antes de firmar.

TheraCloud: pensado para terapeutas

TheraCloud está en Montevideo y apunta a psicólogos, fisioterapeutas, fonoaudiólogos, psicopedagogos y psicomotricistas, solos o en clínicas interdisciplinarias. Tiene agenda compartida, registro de sesiones por voz con transcripción e informes con IA. No publica precios (se entra por demo) y su sitio no menciona CFE. Si sos terapeuta y lo que más te pesa es escribir la nota de la sesión, vale la pena verlo.

Agenda Clínica y el combo gratis

Agenda Clínica es la red de turnos que opera en Uruguay, Paraguay y Chile; el 4 de octubre de 2026 su sitio uruguayo no cargaba, así que no publico precios que no pude ver. Y el combo gratis existe: el portal e-Factura de la DGI emite CFE sin licencia (necesitás certificado digital de Abitab o Correo Uruguayo y tu rango de numeración), más una agenda en Google Calendar y una ficha clínica digital en planilla. Funciona hasta que tenés más de un profesional o tu recepción emite veinte tickets por día a mano.

¿Y la Historia Clínica Electrónica Nacional?

La HCEN es la plataforma nacional, impulsada por el programa Salud.uy de AGESIC y el MSP, que conecta las historias clínicas de los prestadores para que la información siga al paciente; hoy la gente la consulta como "Mi Historia Clínica Digital" en perfil.gub.uy. Está pensada sobre las instituciones del sistema de salud. Un consultorio particular que atiende por fuera de una mutualista no depende de ella para atender ni para facturar, pero sí tiene que llevar su historia clínica en un sistema que la pueda exportar y entregar al paciente cuando la pida.

¿Cuál te conviene según cómo es tu consultorio?

• Profesional solo, pocos pacientes por día: el portal gratuito de la DGI más una buena agenda alcanza. Pagá software cuando el tiempo de emitir a mano te cueste más que la suscripción.
• Terapeuta que escribe mucho: mirá TheraCloud por la transcripción de sesiones, y resolvé el CFE por otro lado.
• Consultorio o clínica que quiere llevar la parte clínica y el negocio en un solo sistema: TotalMed, porque junta CFE con la tasa correcta por servicio, paquetes de sesiones, inventario y reportes del dueño. Si además recibís pacientes de Buenos Aires o tenés socio allá, la lógica cambia (factura C, obras sociales): la explicamos en la guía para consultorios en Argentina.
• Clínica que agenda sobre todo por mensaje: antes de comparar marcas, ordená el canal; está explicado en cómo agendar por WhatsApp sin perder pacientes.

Elegí por lo que hoy te hace perder tiempo en el mostrador. Si es el e-Ticket, la tasa del IVA o cuadrar la caja del día, TotalMed Uruguay lo resuelve en la misma pantalla donde atendés.

Ruben David Cedeño Abreu

Director Comercial de TotalMed. Acompaña a clínicas y consultorios de Latinoamérica a digitalizar su operación y crecer sin perder el control de sus números.