FEL de la SAT: la factura de tu consultorio en Guatemala

FEL significa Factura Electrónica en Línea: el régimen de la SAT por el cual cada documento que emite tu consultorio se certifica en tiempo real y recibe un número de autorización antes de llegar al paciente. Si atiendes en Guatemala como médico, dentista, psicólogo o dueño de una clínica, estás obligado desde enero de 2022 y el talonario dejó de valer.

Actualizado el 30 de septiembre de 2026.

Lo que sigue es lo que cambia en la práctica de una clínica, no el resumen de la ley. Si prefieres ver cómo se resuelve dentro de una agenda, una ficha y una caja, puedes probar TotalMed en Guatemala mientras lees.

¿Desde cuándo tiene que facturar en línea un consultorio en Guatemala?

El sector salud entró al FEL por su propia resolución: la SAT-DSI-1074-2021, vigente desde el 19 de enero de 2022. La SAT la dirigió a profesionales de la salud, hospitales, laboratorios, centros de rehabilitación y distribuidores de equipo médico, antes de extender el mandato a contadores (febrero de 2022) y al régimen general del IVA (julio de 2022).

Después del plazo, las autorizaciones para emitir por otros medios y las facturas con datos del receptor en blanco perdieron efecto: el FEL quedó como la única vía válida. Los pequeños contribuyentes, incluidos los profesionales que facturan poco, tuvieron que sumarse el 31 de marzo de 2023 (resolución SAT-DSI-1350-2022).

¿Cómo viaja una factura FEL desde tu consultorio hasta el paciente?

La factura FEL es un archivo XML que un certificador autorizado por la SAT valida y firma en el momento, y de vuelta te entrega el número de autorización. El circuito es corto: tu sistema genera el XML con el esquema de la SAT, el certificador lo valida, la SAT lo autoriza en tiempo real y el documento certificado se entrega a quien pagó.

Tienes dos puertas. La primera es la propia SAT: en su Agencia Virtual actúa como certificador y sirve para el profesional que emite pocas facturas y las carga a mano. La segunda es un certificador privado autorizado, que se conecta por servicio web a tu software y hace que cada cobro salga facturado sin digitar nada dos veces. En una clínica con recepción y agenda llena, la primera opción se convierte en un segundo trabajo de fin de día.

¿Qué tipo de factura emites: normal o de pequeño contribuyente?

La diferencia está en el régimen del IVA, y define qué documento sale. Un consultorio en el régimen general emite la factura normal, con IVA del 12%. Uno inscrito como pequeño contribuyente emite la factura de pequeño contribuyente y paga un IVA del 5% sobre sus ingresos brutos, sin desglosar el IVA en cada documento.

El límite de ingresos de ese régimen se indexó a 125 salarios mínimos mensuales: pasó de Q150 mil a unos Q465 mil en 2025 y, con el ajuste del salario mínimo, ronda los Q500 mil anuales en 2026. Un consultorio que crece y pasa el tope tiene que migrar al régimen general, y ahí conviene mirar también si el ISR se paga por el régimen sobre utilidades o por el opcional simplificado (5% hasta Q30 mil de ingresos mensuales, 7% sobre el excedente). Confírmalo con tu contador antes de cambiar nada.

La SAT también dispone otros documentos: nota de crédito, nota de débito, nota de abono, recibo y recibo por donación. Para una clínica, los que más se usan son la factura, la nota de crédito y el recibo.

¿Cómo se anula o se corrige una factura FEL?

Desde el 1 de septiembre de 2023 la anulación directa desde la Agencia Virtual solo es posible hasta la fecha de vencimiento de la declaración mensual del IVA. Pasado ese día, el camino es una nota de crédito emitida dentro de los dos meses siguientes a la factura original.

Procede por error de cantidad, precio o descripción, por emisión al NIT equivocado, por una operación que no se realizó o por devolución total. Esto importa más en salud de lo que parece: la sesión que se reprograma, el paquete que el paciente devuelve o el cobro duplicado del pago por WhatsApp son casos de todas las semanas, y cada uno tiene un plazo. Si tu registro del FEL y tu declaración mensual del IVA no coinciden, aparecen requerimientos de la SAT. Compara con otros países: en Ecuador el SRI cambió las reglas de anulación y en Paraguay la DNIT no admite convivir con el talonario; en Guatemala el reloj lo marca la declaración del mes.

El error de recepción que rompe la factura

El error más común no es técnico: es el NIT dicho de oído en la recepción. El paciente da su número mientras firma el consentimiento, alguien lo digita con un dígito cambiado y el documento sale certificado a otro contribuyente. Como el receptor no puede quedar en blanco, si no hay NIT la factura va a "CF", consumidor final, y una vez certificada no se corrige pidiéndole el dato de nuevo al paciente: hay que anular dentro del plazo o emitir una nota de crédito.

En una clínica con varios profesionales el problema se multiplica: cada uno factura por su cuenta o la clínica factura por todos, y sin una regla clara terminas con consultas sin factura y otras facturadas dos veces. Decide quién es el emisor de cada servicio antes de configurar cualquier sistema.

¿Qué reemplaza el FEL en tu día a día?

Reemplaza el cuaderno de caja y la planilla que muchos consultorios guatemaltecos todavía usan para saber cuánto cobraron. Cuando cada cobro pasa por un sistema, la factura se convierte en un subproducto del cobro, no en una tarea aparte, y el cierre del mes deja de ser una reconstrucción a mano.

TotalMed tiene la facturación FEL activa en Guatemala: se conecta a un certificador autorizado por la SAT (Infile), y cada cobro en quetzales sale como documento electrónico desde la misma pantalla en la que registras el pago. Alrededor de eso corren la agenda, la ficha por especialidad, los paquetes de sesiones y las finanzas. Lo que no reemplaza es a tu contador: el régimen tributario que te conviene sigue siendo una decisión suya.

Si hoy sigues facturando desde el portal de la SAT y cierras el mes con una planilla, prueba qué pasa cuando el cobro y la factura son un solo paso en totalmed.lat/gt.

Julianny Ganabela Belandria Dorante

Directora Operativa de TotalMed. Trabaja día a día con clínicas y consultorios de Latinoamérica para ordenar agenda, fichas y caja, y que el equipo opere sin fricción.