SUNAT y tu clínica en Perú: boleta, factura y OSE

La facturación electrónica de la SUNAT para clínicas es la emisión de boleta de venta electrónica (serie B001) y factura electrónica (serie F001) con el IGV del 18% desglosado, validadas por un OSE o un PSE antes de llegar a la SUNAT. Desde el 1 de junio de 2026 (Resolución de Superintendencia N° 000075-2026/SUNAT), un consultorio que se inscribe en el RUC en el Régimen General, el RMT o el RER es emisor electrónico desde el primer día, sin el colchón de tres meses que existía antes.

Actualizado el 5 de octubre de 2026.

Si quieres que cada cobro salga como boleta o factura sin exportar nada, puedes ver cómo funciona TotalMed en Perú conectado a tu propia cuenta de OSE.

¿Qué es un OSE y por qué tu clínica no puede facturar sin uno?

Un OSE es la entidad autorizada por la SUNAT que valida que tu comprobante cumple los requisitos antes de mandarlo a la SUNAT: firma, envía y te devuelve el PDF. Hay poco más de una decena de OSE autorizados, contra más de cien PSE; Nubefact y FactuSmart son dos de los más usados por clínicas y consultorios porque están registrados como OSE y como PSE al mismo tiempo, así que no necesitas contratar dos servicios separados.

El PSE, en cambio, es el sistema que te deja generar y guardar el comprobante de forma automatizada, y en la práctica el rol de OSE está pensado sobre todo para Principales Contribuyentes (Pricos), mientras que el PSE es lo que usa la mayoría de negocios normales. Para un consultorio o una clínica chica, lo habitual es contratar un proveedor que cumpla ambos roles y conectar tu software clínico a su API con tus propias credenciales.

¿RUC 10 o RUC 20? Por qué tu software tiene que distinguirlo

El RUC tiene 11 dígitos y los dos primeros te dicen si eres persona natural o persona jurídica. Si tu RUC empieza con 10, facturas como persona natural con negocio — el consultorio de un solo profesional, por ejemplo. Si empieza con 20, operas como persona jurídica: una S.A.C., una clínica constituida con razón social propia.

Esto no es un detalle administrativo: tu software tiene que pedir el RUC correcto para armar la factura y dejarlo vacío cuando el paciente solo quiere boleta. Un comprobante electrónico ya emitido no se edita: se anula y se vuelve a emitir, así que el dato tiene que quedar bien la primera vez.

¿Boleta o factura? La diferencia que tu paciente no siempre sabe pedir

La boleta de venta electrónica (serie B001) va a un paciente sin RUC que no necesita sustentar el gasto; la factura electrónica (serie F001) va a quien tiene RUC y sí lo necesita, típicamente una empresa que le paga la consulta a su trabajador. Ambas llevan el IGV desglosado al 18% (16% de IGV más 2% del Impuesto de Promoción Municipal), pero solo la factura permite usar ese IGV como crédito fiscal.

Un detalle que se pasa por alto en caja: si la boleta supera los S/ 700, tienes que registrar el documento de identidad del paciente (DNI, carné de extranjería o pasaporte) aunque no pida factura. Las series las asigna la SUNAT automáticamente cuando activas la emisión electrónica — no las inventa tu proveedor de software.

¿Desde cuándo es obligatorio emitir electrónico si recién abres tu consultorio?

Desde el 1 de junio de 2026, cualquier RUC nuevo que se inscribe en el Régimen General, el RMT o el RER queda designado como emisor electrónico desde el primer día, según la Resolución de Superintendencia N° 000075-2026/SUNAT. Antes, el plazo corría desde el primer día del tercer mes siguiente a la inscripción — ese colchón ya no existe. El Nuevo RUS sigue siendo la única excepción.

La misma norma obliga, en paralelo, a llevar el Registro de Ventas e Ingresos y el de Compras a través del SIRE (Sistema Integrado de Registros Electrónicos) desde que nace la obligación de emisión electrónica. Si vas a abrir un consultorio este año, esto no es letra chica: es parte del trámite de apertura, no un paso opcional para después.

¿Por qué más pacientes te van a pedir boleta desde 2026?

Porque la SUNAT les paga por hacerlo. El 7 de julio de 2026 lanzó el sorteo virtual "Pide y Gana" (Resolución de Superintendencia N° 000103-2026/SUNAT): cualquier persona con DNI, carné de extranjería o CPP se inscribe en la plataforma de la SUNAT y registra sus comprobantes electrónicos con el RUC del emisor, el tipo, la serie, el número y la fecha. Puede registrar hasta tres comprobantes por RUC emisor y por fecha de emisión, y cada sorteo reparte 209 premios, de S/ 500 a S/ 100.000, con sorteos separados para Lima y provincias.

El primer sorteo es el 16 de octubre de 2026 (comprobantes del 1 de julio al 30 de setiembre). El segundo, el 16 de febrero de 2027, toma los emitidos entre el 1 de noviembre de 2026 y el 31 de enero de 2027, registrables hasta el 2 de febrero.

En caja se nota así: el paciente que antes se iba sin comprobante ahora lo pide, y vuelve a reclamar si la serie o el número que le diste no aparecen en la SUNAT. Una boleta emitida "después, cuando cuadre la caja" deja de ser un atajo y pasa a ser un reclamo en recepción.

¿Cómo conecta tu software clínico con el OSE, en la práctica?

Hay dos formas de operar: envío automático, donde tu software manda cada boleta o factura al OSE apenas cobras en caja, o carga manual, donde exportas un archivo y lo subes tú al portal del OSE. La segunda funciona, pero duplica trabajo y es donde se pierden comprobantes al cierre de mes.

TotalMed conecta directo con tu propia cuenta de Nubefact o FactuSmart: registras el RUC de tu empresa, eliges tu proveedor OSE, pegas el token o API key de tu panel, y cada cobro sale como boleta o factura ya firmada y enviada a la SUNAT, con el PDF de vuelta al toque. La cuenta del OSE sigue siendo tuya — TotalMed no reemplaza tu contrato con el operador, lo automatiza para que no exportes nada a mano. Ese mismo cobro documentado es la base de ordenar bien tus cuentas médicas, algo que aplica en cualquier país. Otros proveedores del mercado peruano también resuelven esta conexión: SIT-DENTAL trabaja con un PSE certificado por la SUNAT, y Doctocliq tiene su facturación electrónica habilitada para Perú, a diferencia de Chile, donde no emite ante el SII.

Si ya tienes una cuenta con Nubefact o FactuSmart, lo que suele faltar es que tu agenda y tu caja hablen directo con ella. Revisa la comparativa de software para clínicas en Perú si todavía estás eligiendo sistema, o conoce cómo TotalMed opera en tu país en totalmed.lat/pe si ya sabes que quieres automatizar esto.

Julianny Ganabela Belandria Dorante

Directora Operativa de TotalMed. Trabaja día a día con clínicas y consultorios de Latinoamérica para ordenar agenda, fichas y caja, y que el equipo opere sin fricción.